Можно ли считать экономический эффект по экономии производимого тепла, а натуральные показатели указывать по расходуемому ресурсу (газу) в энергопаспорте?

Сомневаюсь. Тепловая энергия это вторичный ресурс. На его производство тратится природный газ, вода, сервисное и техническое обслуживание перерабатывающего оборудования. Если тепловая энергия не расценена (не сформирована внутренняя цена 1 Гкал), то создание комфортных условий у потребителя можно напрямую завязать с газом через формулы пересчёта. Если же у потребителей стоят приборы учёта тепла, то экономить вы будете именно тепло. А вот будете ли вы еще и газ при этом экономить, это уже от начинки котельной будет зависеть.

Значит можно через тариф на отпускаемое тепло. который учитывает расходы и на первичный ресурс (газ) и расходы на производство тепла, считать экономический эффект по тарифу на тепло без учета стоимости газа.

вы можете поделить задачу на две части. В первой части вы проводите улучшения распределительной системы и потребителей тепла. Здесь у вас получается экономия тепловой энергии. Во второй части вы на котельной проводите оптимизацию потребления газа для выработки меньшего количества тепла. Возможно не получится вторую задачу решить просто прикрытием подачи газа. Возможно придётся доустанавливать новое, менее мощное, оборудование.