В филиале "Водоотведения" ГУП "Водоканал СПб" был согласован раздел Очистные сооружения поверхностного стока при особых условиях: Предоставить проект узлов учета на напорной и безнапорной линиях, кто нибудь сталкивался с этим?

Когда то сталкивалась. После очистных для учета сбрасываеимых стоков ставили в колодце датчики на самотечной трубе (труба в колодце шла транзитом).
Ставили ультразвуковые расходомеры такие ВОТ