Можно ли как-то технически осуществить коммерческий учет холодопотребления каждого потребителя (квартиры в жилом доме) в системе чилер-фанкойл?

Можно, но дорого.
Про теплосчетчики что-н будь слышали?

да и не так уж. по 4тыщи счетчики стоят. А без импульсного выхода и того дешевше.

Скорее невозможен.
Из за маленького дельта Т на прямой/обратке теплосчетчики вносят значительные погрешности.