Есть вентилятор и два фильтра подключенные параллельно (на картинке схема), каждый 1200Па. Вопрос в следующем - их сопротивление складывается или учитывается только один, для корректного подбора?

Если сопротивление, указанное Вами, соответствует расходу по соответствующей ветке, ветки симметричны = учитывается одно сопротивление. Изучайте матчасть о параллельных и последовательных подключениях.

Тема пошла в песочницу.