Доброго вечера. Интересует вопрос: как будет вести себя система с рециркуляцией горячей воды например при отключении подачи холодной воды, будет ли насос продолжать гонять воду по своему контуру и нужно ли защитить его от сухого хода?

ГВС через теплообменник организовано? Тогда при отсутствии холодной воды упадёт давление в системе ГВС, и насос будет работать впустую. Ставьте защиту от "сухого хода" обязательно!