Здравствуйте. Впервые столкнулся с таким замечаниям экспертизы.
"Не предусмотрены мероприятия по предупреждению
загрязнения водных объектов при строительстве и эксплуатации объекта
(пункты 4.12, 4.13 ТР 2009/013/BY)."
Подскажите, что это такое и с чем это едят?

как правило, в РФ эти мероприятия в разделах "Охрана окружающей среды" и "Проект организация строительства".
А цитата из какого изменения Техрегламента? Тут по другому изложено:
4.12 экологическая безопасность должна учитывать безопасность как самого человека, ком- фортных условий его жизнедеятельности, так и природных ресурсов: атмосферного воздуха, земли (включая недра и почву), воды (поверхностные и подземные воды), климата, растительного и живот- ного мира; 4.13 проектирование и строительство сооружений должны производиться таким образом, чтобы при их возведении и эксплуатации соблюдались установленные нормы допустимого воздействия на окружающую среду