Есть у кого опыт реализации системы диспетчеризации на Zabbix ? Какие плюсы и минусы. Пока слышал такое, что она полностью бесплатная, работает на linux и на других менее известных платформах.

бесполезная вещь, так как работает только с SNMP. Это для серверов, коммутаторов и так далее. в общем для сетевых дел.

Если в контроллере стоит плата ethernet, то получается все будет нормально работать!?

Простите с ФИГА ли ? контроллер должен поддерживать протокол SNMP чтобы можно было его подключить к zabbix.
SNMP это не наличие Ethernet платы.

В данном случае это реализуется для контроллера carel. Я не знаком с этим протоколом, но судя по тому что человек демонстрировал его работу, в carel есть данный протокол.
А именно по самой программе, какие есть недостатки?

Вроде zabbix может коннектиться к OPC серверам, тогда получается связка "контроллер - OPC - Zabbix".

в Carel действительно есть протокол SNMP, приходилось настраивать. Не забудьте включить его в программе
На счет OPC серверов не в курсе, только тогда пропадает вся прелесть, так как технология OPC это Microsoft и на Linux не работает, если конечно у вас OPC не UA.

з.ы. я не пойму, вам нужно бесплатное решение среди SCADA ? так они есть

Еще раз говорю, zabbix не заточен для мониторинга технологических процессов. Поищите ролики по настройке zabbix, например поищите в нем возможность разложить переменную на биты, самая простая процедура для большинства SCADA систем.