Этаж 2 - венткамера с ПВ установкой.
Этаж 1 - обслуживаемые ПВ установкой помещения (помещения АБК и В3, В4)

Вопрос:
Надо ли изолировать воздуховоды первого этажа как транзитные EI30 (EI15 для зданий III и IV степени огнестойкости)?

Где изолировать? В венткамере? Если воздуховоды к этим вентустановкам - не нужно. Если воздуховоды просто проходят через венткамеру транзитом - нужно.
Смотрите СП 7.13130.2013, п. 6.18 …
Пределы огнестойкости воздуховодов и коллекторов (кроме транзитных), прокладываемых в помещениях для вентиляционного оборудования, а также воздуховодов и коллекторов, прокладываемых снаружи здания, не нормируются.

Если вентиляционная камера на 2-м этаже, а воздуховоды на первом этаже. Считаются ли они воздуховодами "вне обслуживаемого этажа"? (СП 7 таблица В.1 примечание 3)

Обслуживаемым является помещение, для которого предусмотрена система вентиляции. Соответственно, обслуживаемым этажом является этаж с обслуживаемым помещением.

СП 60, п. 3.42 транзитный воздуховод: Участок воздуховода, прокладываемый за пределами обслуживаемого им помещения или группы помещений;

Т.е. у Вас обслуживаемый - 1-й этаж. На 2-ом этаже, если воздуховоды проложены за пределами венткамеры, то это будет "вне обслуживаемого этажа"