Здравствуйте.

Используется Altivar 61 30 кВт, управляет насосом.
На частотнике стоит перемычка "вперед", частота регулируется внешним резистором.

При запуске двигателя даже на малых частотах имеется ток близки к номинальному (50-56 А). Иногда (обычно после долго выключения частотника) можно запустить двигатель, но убавив частоту до 0 и начиная ее прибавлять получаем режим ограничения тока (56 А), при этом напряжение на двигатель (по частонику) - 30-40 вольт.

При этом никаких ошибок не выдается.

После было замечено что напряжения на выходных клеммах частотника разное (между фазами) - может ли это быть связано с какими-то настройками - намагничевание двигателя, режим управления (использовался Энергосбережение и U/f2), удержание момент или еще что-то?

У Вашего ПЧ в какой-то фазе в одном из полуплеч вышел из строя ключ. Чтобы убедиться в этом проверьте ток пофазнона выходе ПЧ.

Чем-кем было замечено?
Напряжения на выходах частотника, по форме, предствляют из себя прямоугольные импульсы, амплитудой 520...600 В, шириной несколько микросекунд. При просмотре осциллографом, надо общую точку брать с "-" конденсатора накопительной емкости.
Для начала надо озвучить параметры двигателя насоса, и где он используется. А то с дуру можно и х... сломать..

Подозреваю, что измерив выходное фазное напряжение каким-нибудь достаточно инертным щитовым вольтметром, например электромагнитной системы, мы можем увидеть значение напряжения, не сильно отличающееся от того, что покажет ПЧ на дисплее.

Проблема то у вас какая? Частотник работает или нет? Ну ток номинальный, он и должен быть при пуске таким.