Здравствуйте. Интересует статус документа "Методические рекомендации по проектированию систем вентиляции жилых и общественных зданий". Является ли данный документ обязательным нормативным документом при проектировании? И где написан его статус?

В ст. 14 № 162-ФЗ "О стандартизации в Российской Федерации" перечислены документы по стандартизации. Никаких Рекомендаций там, конечно, нет и быть не может.
Любые Рекомендации/Пособия/Справочники вообще не являются документами, тем более, нормативными. Ими можно пользоваться в частях, не противоречащих действующим нормативным документам.

Тогда интересует пункт 5.1.2.8 Систему вентиляции с естественным удалением воздуха выполняют
с удалением воздуха через теплый чердак с единой шахтой на кровле (рисунок
1) или через раздельные каналы, выводимые на кровлю (рисунок 2).
В зданиях высотой 5–6 этажей и менее воздух следует удалять
вертикальными каналами с самостоятельным выпуском его в атмосферу (см.
рисунок 3).
В СП60 вообще нет никаких указаний по устройству вентиляции жилых зданий, в частности по устройству теплого чердака или без чердака или с холодным чердаком. В таком случае пользуемся этой методичкой? Если проектное решение не соответствует этой методичке имеет ли право эксперт требовать сделать по этой методичке?

Для "тёплого чердака" есть свои Рекомендации по его конструктивному устройству с методикой расчёта. Если Вы не знакомы с этими Рекомендациями, то каким образом Вы смогли выполнить все необходимые расчёты?
В п. 7.1 этих Рекомендаций есть также указания по этажности здания. Для 5-ти-этажных домов необходимо выполнить ТЭО применения "тёплого чердака". Сразу скажу - для 5-6-ти-этажных зданий вряд ли сможете обосновать, там просто не хватает воздуха и высоты вентканалов для такого устройства.
Ещё следует обратить серьёзное внимание на указание СП 60.13330.2020:

Это указание сразу исключает возможность применения "тёплого чердака" в МЖД с газовыми плитами - вытяжки из с/у и ванных очень мало, недостаточно для такого устройства и нецелесообразно уже даже для 9-10-ти-этажных зданий.

Т.о., Вы не сможете представить эксперту расчёт, подтверждающий легитимность своего проектного решения. А эксперт такой расчёт обязательно затребует.

Не смотрят они на эту методичку)

Мне написали замечание по этой методичке)