Подскажите, есть ли (и если есть, где прописаны) условия/ограничения на прокладку воздуховодов приточной и вытяжной систем противодымной вентиляции? В частности интересует возможность прокладки транзитных воздуховодов противодымной вентиляции через помещения (медицина, лечебно-диагностический комплекс), дополнительно, прям совсем в частности, через операционные. По общеобменной вентиляции есть, по противодымной не попалось.

Для противодымной вентиляции отсутствует понятие "транзитный воздуховод". В СП 7 даны только соответствующие указания по огнестойкости воздуховодов в пределах и за пределами обслуживаемого отсека. Соответственно, нет и дополнительных (по отношению к СП 60) запретов.
Что касается операционных:
По действующему СП 2.1.3678-20:

По отменённому СанПиН 2.1.3.2630-10:

В обоих случаях формулировки некорректны - похоже, санитары относят воздуховоды к трубопроводам. Но утверждать это также не представляется возможным.
Судя по 2-ому предложению в обеих версиях, воздуховоды в помещениях класса чистоты А можно прокладывать только скрыто, в остальных помещениях - в закрытых коробах. Что интересно - к коробам никакие требования не предъявлены.