Проектировщик вывел шахты Естественной вентиляции от тепл.пункта, эл.щитовой., кладовки., винного поглеба., в один блок на крыше.,т.е. каналы у всех систем разные но выведены в один над кровельный блок с прямоугольным зонтом., можно ли так делать? И нарушил ли какие либо нормы проектировщик, если нарушил то покажите пожалуйста ссылку на нормы и пункт?

Так делать можно. Нормы не нарушены.

по компоновке вопросов нет.
Можно для меня пояснить.
СП55.13330-2016 п. 9.7. требует минимальную кратность 0,2.
СП60.13330-2016 п. 7.1.3. "вентиляцию с механическим побуждением следует применять если естественной не обеспечиваются нормативные параметры".

Вопрос: как естественная вытяжка (а мы помним, что у коттеджа в силу его высоты тяга ВЕ никакая) обеспечивает указанную кратность при температурах наружного воздуха выше комнатной (а для винного погреба - и того ниже)?

Есть же требование по расчету естестенной вытяжки на +5 градусов.
7.1.10 Естественную вытяжную вентиляцию для жилых, общественных, административных и бытовых помещений следует рассчитывать на разность плотностей наружного воздуха при температуре 5°С и внутреннего воздуха при нормируемой температуре в холодный период года. Поступление наружного воздуха в помещения следует предусматривать через специальные приточные устройства в наружных стенах или окнах. Для квартир и помещений, в которых при температуре наружного воздуха 5°С не обеспечивается удаление нормируемого расхода воздуха, следует предусматривать механическую вытяжную вентиляцию.

По заданию на проектирование допускается предусматривать для жилых зданий механическую приточную-вытяжную вентиляцию с применением индивидуальных поквартирных приточно-вытяжных установок или централизованных приточных и вытяжных установок.

Это расчетное нормированное значение. А применять на объекте естественную или механическую выентиляцию - решать вам и заказчику.
И да естественная вентиляция не работает круглый год в расчетном режиме, но это не является нарушением

Не обеспечение является нарушением. Просто для некоторых типов помещений есть допущения и они прописываются в нормах.
Если техническое помещение шкаф для сушки, а объект в краснодарском крае то естевенная вентиляция не будет работать 90% дней в году, и это будет косяком проектировщиков

По факту да, по нормам нет.

В нашей стране две реальности, причем не только в сфере строительства

Что по нормам нет???

Это как?
Т.е. если нарушил и не сел на кол, то вроде как и не нарушил?

Хм, вроде бы человек ясно написал: по нормам расчет делаем на +5. По физике процесса мы знаем, что при больших температурах естественная вентиляция работает хуже, значит и расходы будут меньше расчетного. Значит расходы будут меньше тех, которые предусмотрены нормами.
Аналогично, отопление считается на температуру холодной пятидневки, фактическая температура может оказаться ниже, значит в обслуживаемом помещении температура станет ниже расчетной. Нормы не нарушены, в помещении холодно.

п. 7.1.10 не нарушен,
но 7.1.3. и прил "И" нарушены.
Т.е. нормы нарушены.

Можно, а для удобство под крышей устанавливают теплообменник с рекуператором как на примере
https://www.youtube.com/watch?v=XpUacNV3KiM