Добрый день,
Подскажите кто устанавливал и использовал в автоматизации Linux based controller? Какие производители и контроллеры на Линукс можете порекомендовать?

Подобные контроллеры используем когда нужно сделать АСУ ТП на промышленных предприятиях. Контроллер используется в качестве мастера на довольно таки распределенной сети.
По требованиям заказчика использовали на 2-х заводах оборудование УМИКОН. Оборудование заточено под пром.автоматику, по этому не особо распространено в ЖКХ и инфу найти трудно. Приходится вплотную работать с производителем.
Обычно в качестве мастера использем PC200 http://www.umikon.ru/index.php?option=com_...4&Itemid=29
У него на борту 6 развязанных RS-845 и 2 Ethernet, а также возможность подключения клавиатуры, мыши и монитора . Правда стоит такой контроллер в районе 95000руб. Но производитель позиционирует свое оборудование, как конкурент промышленных сименовских контроллеров. А те стоят еще больше.
а если не сектрет, зачем вам понадобился такой контроллер?

Смотря для какого применения.
Например, у Хоневелл есть целое семейство контроллеров Excel WEB на базе Linux для ОВК.

Простите, а писать предполагается программу на C/C++ ?
p.s. вот например linux контроллер

У MOXA есть на RISC процессорах контроллеры-интерфейсы (RS422|485|232, Ethernet)

А для какой задачи-то? Вот, ICP например: http://www.nnz-ipc.ru/good/listAll/17556/. У Овена в некоторых контроллерах встроен Linux: http://www.owen.ru/ru/about/13568456. Здесь еще упоминали Wago и MOXA. Сегнетикс также разместил анонс своего контроллера: http://www.segnetics.com/main.aspx?Page=357