Насколько существенно изменение гидравлики (интересуют диаметры) при разных материалах трубы. Например, пластиковая и металлопластик (потери давления разные). Систему отопления проектировали на пластиковой трубе(при Q=2500Вт был d=16), монтировать решили на металлопластиковой d=16. Возникает вопрос будет ли работать такая система?

Не стоит этого делать. Внутренний диаметр у металлопласта даже больше, но фитинги-сплошное расстройство.
Работать БУДЕТ!!! Если насос поставите дикий или если коллекторную разводку сделаете. Но и то и другое надо в проекте учитывать.

Разводка коллекторная, смущает при такой нагрузке и диаметре большое сопротивление. К тому же на этой ветке находятся три отопительных прибора