Монтажники собрали ПВУ по такой схеме - приток снизу, вытяжка сверху. Насколько вообще такая схема работоспособна? Приточный воздух снизу подавался в рекуператор, проходил через жалюзи рекуператора, которые направлены вниз. Каплеуловитель установлен сверху, вода будет там отбираться или, все-таки, она будет стекать по заслонкам/жалюзи? Не видел ни разу, чтобы жалюзи рекуператора были вниз направлены.

Какие "жалюзи рекуператора"? Это о клапане байпаса, что ли? Так он в приточной линии, какая там вода и какое стекание?
Каплеуловителю без разницы где находиться, его задача не пропускать капли, которые несёт поток воздуха. Если Ваши монтажники перепутали положение секции рекуператора, то проблема Ваше не в каплеуловителе.

Можно две схемы ,"было предусмотрено так" и "смонтировано так"? По Вашей схеме и приложенному фото гадать не особо хочется.

Да, вопрос про клапаны байпаса рекуператора. Допустимо монтировать рекуператор таким образом, чтобы клапаны (заслонки) были направлены не вверх, а вниз. У меня приток сделали с нижней секции (верхняя секция вытяжка) и капаны рекуператора направлены вниз "к полу".

Если клапан находится на линии притока и до рекуператора по ходу воздуха, то вверх или вниз значения не имеет. Конденсат образуется в вытяжном, не в приточном.

все зависит от конкретного конструктива, если конструкцией предусмотрена такая компоновка, то все работать, скорее всего, будет.
если нет - нет.
запрашивайте производителя.

В случае стекания жидкости вниз по каналам рекуператора, поддон стоит под капельником , внизу будет лужа, которая никак не будет отводиться наружу ПВУ. Остальные параметры индивидуальны, какая влажность, скорость потока, производительность и т.п.